中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所位于上海市閔行區(qū)，成立于1964年，其前身為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 家畜血吸蟲病研究室，1982年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海家畜血吸蟲病研究所，1989年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海家畜寄生蟲病硏究所，2002年被列為國家非營利性科研機構(gòu)，2006年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)硏究所，并成立中國動物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心上海分中心。2021年3月，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院委托研究所成立了生物安全研究中心。

以習(xí)近平新時代中國特色社會主義思想為指導(dǎo)，落實”四個面向""兩個一流”和"一個整體躍升”的總要求，貫徹"人病獸防、關(guān)口前移、源頭治理”的重要指示，聚焦國家農(nóng)業(yè)生物安全"主責(zé)主業(yè)"，圍 繞"國之大者"抓主抓重，以重大動物疫情、人畜共患病、重大外來病等為對象，開展生物安全公共政策、基礎(chǔ)理論、監(jiān)測預(yù)警、技術(shù)攻關(guān)、產(chǎn)品研發(fā)、集成應(yīng)用等全鏈條研究，為保障國家農(nóng)業(yè)生物安全、 科技自立自強提供戰(zhàn)略支撐。

研究所現(xiàn)有在職職工146名，高級職稱專家77名，碩博導(dǎo)師67人。內(nèi)設(shè)7個行政管理部門和6個研 究室，建立了11個創(chuàng)新科研團隊。依托研究所建有國家防治血吸蟲病參考實驗室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動物生 物安全風(fēng)險預(yù)警及防控重點實驗室（北方）等10個科技平臺，編輯出版《中國動物傳染病學(xué)報》。

建所以來，承擔(dān)各類科研項目1000余項。獲得國家省部級獎勵成果68項；獲得國家各類新獸藥證書15項，其中一類新獸藥證書4項；發(fā)表論文2800余篇，其中SCI收錄論文1000余篇；出版專著76部；獲得國家發(fā)明專利129件。

研究所連續(xù)四屆被授予全國血防先進集體稱號，獲評第五屆全國文明單位、歷屆上海市文明單位，多次獲評中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院文明單位。