中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所位于上海市閔行區(qū)，成立于1964年，其前身為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 家畜血吸蟲病研究室，1982年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海家畜血吸蟲病研究所，1989年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海家畜寄生蟲病硏究所，2002年被列為國家非營利性科研機(jī)構(gòu)，2006年更名為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)硏究所，并成立中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心上海分中心。2021年3月，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院委托研究所成立了生物安全研究中心。

以習(xí)近平新時(shí)代中國特色社會(huì)主義思想為指導(dǎo)，落實(shí)”四個(gè)面向""兩個(gè)一流”和"一個(gè)整體躍升”的總要求，貫徹"人病獸防、關(guān)口前移、源頭治理”的重要指示，聚焦國家農(nóng)業(yè)生物安全"主責(zé)主業(yè)"，圍 繞"國之大者"抓主抓重，以重大動(dòng)物疫情、人畜共患病、重大外來病等為對(duì)象，開展生物安全公共政策、基礎(chǔ)理論、監(jiān)測(cè)預(yù)警、技術(shù)攻關(guān)、產(chǎn)品研發(fā)、集成應(yīng)用等全鏈條研究，為保障國家農(nóng)業(yè)生物安全、 科技自立自強(qiáng)提供戰(zhàn)略支撐。

研究所現(xiàn)有在職職工146名，高級(jí)職稱專家77名，碩博導(dǎo)師67人。內(nèi)設(shè)7個(gè)行政管理部門和6個(gè)研 究室，建立了11個(gè)創(chuàng)新科研團(tuán)隊(duì)。依托研究所建有國家防治血吸蟲病參考實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物生 物安全風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警及防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（北方）等10個(gè)科技平臺(tái)，編輯出版《中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào)》。

建所以來，承擔(dān)各類科研項(xiàng)目1000余項(xiàng)。獲得國家省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)成果68項(xiàng)；獲得國家各類新獸藥證書15項(xiàng)，其中一類新獸藥證書4項(xiàng)；發(fā)表論文2800余篇，其中SCI收錄論文1000余篇；出版專著76部；獲得國家發(fā)明專利129件。

研究所連續(xù)四屆被授予全國血防先進(jìn)集體稱號(hào)，獲評(píng)第五屆全國文明單位、歷屆上海市文明單位，多次獲評(píng)中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院文明單位。