基因組所成立于2014年，由農業(yè)農村部、中國農業(yè)科學院和深圳市政府共同支持建設，實行理事會管理，探索體制機制創(chuàng)新，致力于建設世界一流農業(yè)科研院所。

成立以來，基因組所深入貫徹落實習近平總書記“四個面向、兩個一流”指示精神，先后開展科研自主權改革、科技人才分類評價等國家級科技體制改革試點工作，被列為中國農業(yè)科學院現代院所改革的“試驗田”；成立了組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態(tài)基因組、食品科學等研究中心和相關技術平臺，形成了以多組學技術、基因編輯技術和合成生物學技術為基礎，以生物育種和食品健康為方向的“3+2”學科體系；參與建設“熱帶作物生物育種全國重點實驗室”，獲批“嶺南現代農業(yè)科學與技術廣東省實驗室深圳分中心”“農業(yè)農村部農業(yè)基因數據分析重點實驗室”等創(chuàng)新載體；在包括 Science、Nature、Cell 等頂級期刊在內的雜志上發(fā)表論文1500多篇，以基因組設計育種育成國審、省審新品種40余個，農業(yè)基因組學等研究領域占據世界前沿。2019年以來自然指數排名全國農業(yè)類科研院所前列，多項成果入選“‘十三五’十大農業(yè)科技標志性成果”“中國生命科學十大進展”“中國農業(yè)科學重大進展”“中國農業(yè)農村重大新技術”等，先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎科學獎”“全國創(chuàng)新爭優(yōu)獎”“深圳經濟特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進模范人物”“深圳市市長獎”“廣東省五一勞動獎狀”等獎勵。

基因組所將立足國家戰(zhàn)略需求和地方經濟社會發(fā)展需要，致力于農業(yè)高水平科技自立自強，打造國際一流的生命科學和生物農業(yè)原始創(chuàng)新引擎。

綜合辦公室更新于2024年7月