云南中醫(yī)藥第二臨床醫(yī)學院現(xiàn)承辦針灸推拿學、康復治療學、中醫(yī)康復學和中醫(yī)養(yǎng)生學四個專業(yè)。針灸推拿學專業(yè)1985年開始招生，康復治療學專業(yè)2012年開始招生，中醫(yī)康復學和中醫(yī)養(yǎng)生學專業(yè)2018年開始招生。針灸推拿學、康復治療學專業(yè)為云南省省級一流專業(yè)、云南省省級特色建設專業(yè)、云南省省級綜合改革試點專業(yè)。推拿學為國家中醫(yī)藥管理局“十二五”中醫(yī)藥重點學科，針灸學為云南省省級重點學科。針灸推拿學專業(yè)2000年獲批碩士學位授權點，2018年獲批博士學位授權點。中西醫(yī)結合康復學專業(yè)2015年獲批碩士學位授權點。

2020年7月，針灸推拿康復學院與第二附屬醫(yī)院“院院合一”，成立第二臨床醫(yī)學院，設置18個職能科室，23個臨床醫(yī)技科室。學院設針灸基礎、實驗針灸、針灸臨床、推拿基礎、推拿臨床、康復治療、中醫(yī)康復和中醫(yī)養(yǎng)生8個教研室及1個針灸推拿康復研究所；附屬醫(yī)院設6個臨床教研室。現(xiàn)有專任教師61人，醫(yī)編教師47人，其中具有博士學位的19人，碩士學位的34人；正高職稱的22人，副高職稱的77人。截至目前，針灸推拿學和中西醫(yī)結合康復學兩個學位點擁有碩士研究生導師70人，中醫(yī)學學位點擁有博士研究生導師2人，3人被評為云南省名中醫(yī)。截止2021年12月31日，在校學生2381名，其中本科生2118名，研究生263名。

近三年，學院主持國家級科研基金項目7項，省級及廳局級科研項目30余項，科研經費達900余萬元；在SCI源、中文核心、科技核心及省級雜志發(fā)表論文180余篇；科研成果獎勵6項（含云南省科技進步二等獎1項），發(fā)明專利3項，實用新型專利20余項，轉化1項；編寫教材30部，建省級專家工作站2個，在建第七批云南省高校重點實驗室及云南省高?？萍紕?chuàng)新團隊各1個、教學實訓平臺2個，立項質量工程15項、校級重點課程7門、在線課程1門。

目前，針灸推拿學和中西醫(yī)結合康復學兩個學位點擁有碩士研究生導師70人，中醫(yī)學學位點擁有博士研究生導師2人，3人被評為云南省名中醫(yī)。截止2021年12月31日，在校學生2381名，其中本科生2118名，研究生263名。

為不斷提升教學質量，我院積極探索以培養(yǎng)學生綜合素質、創(chuàng)新能力及臨床運用能力為目標的實驗教學模式，有效利用學生課余空閑時間，建立“課上與課下相聯(lián)系”、“理論與實踐相聯(lián)系”、“實踐與臨床相聯(lián)系”3個層次的教學體系。近年來，我院師生在全國各類比賽中取得了優(yōu)異的成績：2014年、2018年、2021年均獲全國中醫(yī)藥院校針灸推拿臨床技能大賽團體二等獎，2016年獲全國中國醫(yī)藥院校針灸推拿臨床技能大賽團體三等獎；學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項目獲各級各類立項30余人次，“心手相望”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)團隊在首屆全國康復醫(yī)學創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽中榮獲全國第五名及“網友最喜歡的創(chuàng)業(yè)項目獎”；學生“手指肌力分層訓練儀”已獲得國家專利。2018年本科就業(yè)率為98.20%，2019年為96.77%，受疫情影響，2020和2021年本科就業(yè)率分別為89.49%和85.95%；近四年研究生就業(yè)率均為100%。