體育系始建于1975年，1977年招收本科生，2006年獲批碩士學位授予權（體育教育訓練學），2009年更名為體育科學學院，是黑龍江省外高校最早獲得碩士授予權院系之一，是我校首批獲得碩士學位授予權的四個學科之一。2010年以后，學院先后被黑龍江省體育局體育科學學會授予學校體育專業(yè)委員會主任單位，黑龍江省教育廳授予高校體育專業(yè)組組長單位，黑龍江省東南部高校體育研究會會長單位，牡丹江市授予體育學領軍人才梯隊帶頭人單位等。

學院現(xiàn)有專職教師52名，其中教授、副教授29人，博士6人，碩士41人。師資梯隊合理，科研實力較強，4個方向的學術帶頭人及團隊科研基礎良好，在該領域已取得了豐碩的成果。近5年教師發(fā)表論文169篇，其中中文核心期刊32篇、EI期刊2篇、檢索收錄22篇；課題86項，其中國家社科基金主持和參與3項、省部級10項、廳級36項；著作教材33部；各級科研獲獎75項，其中省部級以上36項；國家專利38項，其中發(fā)明專利3項；累計科研經費176.59萬元；獲省教學成果二等獎2項，校級教學成果一等獎2項。先后承辦國際會議3次，參加國內外學術會議32次，現(xiàn)場報告10次，大會報告3次。兩獲“教育強市、我當先鋒”先進集體；兩名教師獲市“五一”勞動獎章；三名教師獲省技能大賽一等獎；多名教師獲羽毛球、網球比賽優(yōu)異成績。研究生發(fā)表論文475篇、承擔省、校級項目59項、獲省級科研獎勵14項；4名研究生到中國農業(yè)科學院從事肌腱干細胞及損傷動物模型建立等研究。

學院設有體育教育和社會體育指導與管理兩個專業(yè)，均為校級重點專業(yè)，體操、田徑、籃球、健美操、大學體育等5門課程先后被評為省級重點和校級精品課程。

學院現(xiàn)有運動解剖學等7個實驗室和大學生體質測試中心。儀器設備300余臺套，價值200余萬元。擁有標準的塑膠田徑場、室外籃球、足球、排球、網球場等；有容納1600人的綜合體育館；50米標準游泳館；1000平方米體操館；600平方米乒乓球館；300平方米健美操室及400平方米的健美健身中心等。

2010年以來，學院先后榮獲國家級、省級、市級等運動競賽800多項獎勵，2017年學院代表黑龍江省參加中華人民共和國第十三屆運動會龍舟比賽并進入決賽，單項取得第十名的成績。為國家殘疾人滑雪隊提供技術支持，舉辦7次科學健身講座，負責完成牡丹江國民體質監(jiān)測工作。

體育科學學院以服務區(qū)域體育為宗旨，突出國家需要與區(qū)域需要，形成了良好的理論與方法體系及系列學科研究成果。多年來為黑龍江省和牡丹江市乃至全國輸送了一批又一批的體育專業(yè)人才。畢業(yè)生受到社會普遍歡迎，就業(yè)率逐年提升，為地方經濟建設與社會發(fā)展做出了積極的貢獻。

十三五期間，體育科學學院根據國家戰(zhàn)略、區(qū)域經濟社會、文化和學科發(fā)展的新形勢、新要求，與時俱進、深化改革，銳意創(chuàng)新，培養(yǎng)出更多適合社會需求的體育專業(yè)應用型人才。