1956年12月，河南省鄭州衛(wèi)生學校遷至鄭州市緯五路東段，更名為河南省鄭州第一衛(wèi)生學校，增設(shè)藥劑士專業(yè)，學制三年。這是河南大學藥學院藥學專業(yè)的前身。

1958年6月，經(jīng)河南省人民政府批準，河南省鄭州第一衛(wèi)生學校升格為大學專科，更名為河南省醫(yī)藥?？茖W校，設(shè)醫(yī)療、藥學2個專業(yè)。

1959年2月，河南省文教部決定，河南省醫(yī)藥?？茖W校遷至開封，更名為開封醫(yī)藥專科學校。

1984年，開封醫(yī)藥?？茖W校藥學專業(yè)改建為藥學系。

1992年，開封醫(yī)藥專科學校更名為開封醫(yī)學高等?？茖W校。

2000年7月，開封醫(yī)學高等專科學校與河南大學合并，開封醫(yī)學高等?？茖W校藥學系更名為河南大學醫(yī)學院藥學系。

2001年4月，河南大學醫(yī)學院藥學系改建為河南大學藥學院，開始藥學本科教育。2003年，獲批碩士學位授予點。2015年獲批博士學位授權(quán)點。

2016年10月，更名為河南大學醫(yī)學院藥學院。

經(jīng)過60年發(fā)展，藥學院已成為中國教育學會藥學教育分會常務(wù)理事單位、全國杜仲產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟副理事長單位，中華中醫(yī)藥學會中藥教育專業(yè)委員會副秘書長單位，河南省藥學會副理事長單位，河南省藥學會中藥資源專業(yè)委員會主任委員單位，河南省執(zhí)業(yè)藥師協(xié)會副會長單位。2005年6月，劉昌孝院士受聘擔任藥學院名譽院長。

學院現(xiàn)有教職工102人，其中教授23人，副教授26人，具有博士學位教師63人，博士生導(dǎo)師9人，碩士生導(dǎo)師64人。雙聘院士1人；河南省百人計劃人才1人；校“杰出人才特區(qū)第四層次”特聘教授2人、校外籍專家和國內(nèi)專家“拔尖人才項目”卓越人才4人、黃河學者3人、校特聘教授5人；國家新藥、保健食品和化妝品評審專家7人；國家執(zhí)業(yè)藥師工作專家5人；河南省執(zhí)業(yè)藥師工作專家5人；河南省學術(shù)技術(shù)帶頭人1人；河南省創(chuàng)新人才1人；河南省高校創(chuàng)新人才1人；河南省教育廳學術(shù)技術(shù)帶頭人6人。目前，在校全日制本科生902人，來自27個?。ㄖ陛犑校⒆灾螀^(qū)；在校博士、碩士研究生240人；在校成人教育學生1000余人。

學院有藥學、中藥學、臨床藥學3個本科專業(yè)。2021年，藥學專業(yè)入選國家一流本科專業(yè)建設(shè)點。擁有藥理學、天然藥物化學、生藥學、生物化學、藥事管理學等省、校級教學質(zhì)量工程項目35項。設(shè)有9個教研室、教學實驗室和科研實驗室等2個實驗室、分析測試中心。

學院有藥物系統(tǒng)生物學二級學科博士學位授權(quán)點，藥學、中藥學2個一級學科碩士學位授權(quán)點，中藥學、教育碩士（醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域）專業(yè)學位碩士點。2017年4月，中藥學專業(yè)順利通過教育部中藥學類專業(yè)教學指導(dǎo)委員會組織的專業(yè)認證。中藥學、藥學為河南省重點一級學科。中藥藥效物質(zhì)與創(chuàng)新藥物研究團隊、藥食兩用資源研究開發(fā)團隊等兩個團隊為河南省高校創(chuàng)新團隊。

學院建有杜仲栽培與利用河南省工程實驗室、河南省中藥藥效國際聯(lián)合實驗室、河南省藥學實驗教學示范中心、河南省中藥學虛擬仿真實驗教學中心、河南省藥食兩用資源功能國際聯(lián)合實驗室、中央與地方共建高校特色優(yōu)勢學科藥物制劑實驗室、河南省藥物物質(zhì)基礎(chǔ)重點實驗室（培育）、河南省高校無機離子工程技術(shù)研究中心、河南省高校杜仲栽培與利用工程技術(shù)研究中心、河南省抗腫瘤中藥藥效物質(zhì)研究院士工作站，開封菊花藥食功效開發(fā)開封市重點實驗室和開封市保健食品功效成分研究實驗室。

學院治學態(tài)度嚴謹，學術(shù)氛圍濃郁。五年來，先后承擔國家自然科學基金、國家973項目、國家科技支撐計劃、國家行業(yè)性公益專項、國家中藥標準化項目、創(chuàng)新藥物等國家級課題73項。發(fā)表論文500多篇，其中SCI 93篇，出版論著32部，授權(quán)發(fā)明專利35項，獲得各類科研教學獎勵62項。注重提升服務(wù)地方經(jīng)濟社會發(fā)展能力，堅持政產(chǎn)學研用有機結(jié)合，橫向項目總金額近千萬元，杜仲、菊花、連翹、辛夷等深加工項目已成為區(qū)域經(jīng)濟科學發(fā)展、農(nóng)民增收的重要支柱，彰顯了學院的專業(yè)優(yōu)勢和社會服務(wù)能力。

學院設(shè)有泰豐獎學金、羚銳獎學金、新春都藥學人才獎學金、常樂制藥獎學金等企業(yè)獎學金。堅持文化育人、實踐育人，培養(yǎng)應(yīng)用型、創(chuàng)新型、復(fù)合型人才，畢業(yè)生動手能力強、綜合素質(zhì)高。多年來，本科生考研率穩(wěn)步提高，2020年考研率高達50％，就業(yè)率穩(wěn)定在98%左右。涌現(xiàn)出原河南省藥監(jiān)局局長張澤書，河南省衛(wèi)計委主任闞全程，河南泰豐集團董事長徐攀峰，揚子江藥業(yè)集團廣州公司總經(jīng)理臧鑫炎等一大批中高級醫(yī)藥行業(yè)經(jīng)營管理人才和業(yè)務(wù)骨干。13000多名校友遍布海內(nèi)外。