1956年12月，河南省鄭州衛(wèi)生學(xué)校遷至鄭州市緯五路東段，更名為河南省鄭州第一衛(wèi)生學(xué)校，增設(shè)藥劑士專業(yè)，學(xué)制三年。這是河南大學(xué)藥學(xué)院藥學(xué)專業(yè)的前身。

1958年6月，經(jīng)河南省人民政府批準(zhǔn)，河南省鄭州第一衛(wèi)生學(xué)校升格為大學(xué)專科，更名為河南省醫(yī)藥?？茖W(xué)校，設(shè)醫(yī)療、藥學(xué)2個專業(yè)。

1959年2月，河南省文教部決定，河南省醫(yī)藥?？茖W(xué)校遷至開封，更名為開封醫(yī)藥?？茖W(xué)校。

1984年，開封醫(yī)藥?？茖W(xué)校藥學(xué)專業(yè)改建為藥學(xué)系。

1992年，開封醫(yī)藥?？茖W(xué)校更名為開封醫(yī)學(xué)高等?？茖W(xué)校。

2000年7月，開封醫(yī)學(xué)高等?？茖W(xué)校與河南大學(xué)合并，開封醫(yī)學(xué)高等?？茖W(xué)校藥學(xué)系更名為河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系。

2001年4月，河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系改建為河南大學(xué)藥學(xué)院，開始藥學(xué)本科教育。2003年，獲批碩士學(xué)位授予點(diǎn)。2015年獲批博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。

2016年10月，更名為河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院。

經(jīng)過60年發(fā)展，藥學(xué)院已成為中國教育學(xué)會藥學(xué)教育分會常務(wù)理事單位、全國杜仲產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟副理事長單位，中華中醫(yī)藥學(xué)會中藥教育專業(yè)委員會副秘書長單位，河南省藥學(xué)會副理事長單位，河南省藥學(xué)會中藥資源專業(yè)委員會主任委員單位，河南省執(zhí)業(yè)藥師協(xié)會副會長單位。2005年6月，劉昌孝院士受聘擔(dān)任藥學(xué)院名譽(yù)院長。

學(xué)院現(xiàn)有教職工102人，其中教授23人，副教授26人，具有博士學(xué)位教師63人，博士生導(dǎo)師9人，碩士生導(dǎo)師64人。雙聘院士1人；河南省百人計(jì)劃人才1人；?！敖艹鋈瞬盘貐^(qū)第四層次”特聘教授2人、校外籍專家和國內(nèi)專家“拔尖人才項(xiàng)目”卓越人才4人、黃河學(xué)者3人、校特聘教授5人；國家新藥、保健食品和化妝品評審專家7人；國家執(zhí)業(yè)藥師工作專家5人；河南省執(zhí)業(yè)藥師工作專家5人；河南省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人1人；河南省創(chuàng)新人才1人；河南省高校創(chuàng)新人才1人；河南省教育廳學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人6人。目前，在校全日制本科生902人，來自27個?。ㄖ陛犑校?、自治區(qū)；在校博士、碩士研究生240人；在校成人教育學(xué)生1000余人。

學(xué)院有藥學(xué)、中藥學(xué)、臨床藥學(xué)3個本科專業(yè)。2021年，藥學(xué)專業(yè)入選國家一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)。擁有藥理學(xué)、天然藥物化學(xué)、生藥學(xué)、生物化學(xué)、藥事管理學(xué)等省、校級教學(xué)質(zhì)量工程項(xiàng)目35項(xiàng)。設(shè)有9個教研室、教學(xué)實(shí)驗(yàn)室和科研實(shí)驗(yàn)室等2個實(shí)驗(yàn)室、分析測試中心。

學(xué)院有藥物系統(tǒng)生物學(xué)二級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，藥學(xué)、中藥學(xué)2個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，中藥學(xué)、教育碩士（醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域）專業(yè)學(xué)位碩士點(diǎn)。2017年4月，中藥學(xué)專業(yè)順利通過教育部中藥學(xué)類專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會組織的專業(yè)認(rèn)證。中藥學(xué)、藥學(xué)為河南省重點(diǎn)一級學(xué)科。中藥藥效物質(zhì)與創(chuàng)新藥物研究團(tuán)隊(duì)、藥食兩用資源研究開發(fā)團(tuán)隊(duì)等兩個團(tuán)隊(duì)為河南省高校創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)。

學(xué)院建有杜仲栽培與利用河南省工程實(shí)驗(yàn)室、河南省中藥藥效國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、河南省藥學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、河南省中藥學(xué)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、河南省藥食兩用資源功能國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、中央與地方共建高校特色優(yōu)勢學(xué)科藥物制劑實(shí)驗(yàn)室、河南省藥物物質(zhì)基礎(chǔ)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（培育）、河南省高校無機(jī)離子工程技術(shù)研究中心、河南省高校杜仲栽培與利用工程技術(shù)研究中心、河南省抗腫瘤中藥藥效物質(zhì)研究院士工作站，開封菊花藥食功效開發(fā)開封市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和開封市保健食品功效成分研究實(shí)驗(yàn)室。

學(xué)院治學(xué)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，學(xué)術(shù)氛圍濃郁。五年來，先后承擔(dān)國家自然科學(xué)基金、國家973項(xiàng)目、國家科技支撐計(jì)劃、國家行業(yè)性公益專項(xiàng)、國家中藥標(biāo)準(zhǔn)化項(xiàng)目、創(chuàng)新藥物等國家級課題73項(xiàng)。發(fā)表論文500多篇，其中SCI 93篇，出版論著32部，授權(quán)發(fā)明專利35項(xiàng)，獲得各類科研教學(xué)獎勵62項(xiàng)。注重提升服務(wù)地方經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展能力，堅(jiān)持政產(chǎn)學(xué)研用有機(jī)結(jié)合，橫向項(xiàng)目總金額近千萬元，杜仲、菊花、連翹、辛夷等深加工項(xiàng)目已成為區(qū)域經(jīng)濟(jì)科學(xué)發(fā)展、農(nóng)民增收的重要支柱，彰顯了學(xué)院的專業(yè)優(yōu)勢和社會服務(wù)能力。

學(xué)院設(shè)有泰豐獎學(xué)金、羚銳獎學(xué)金、新春都藥學(xué)人才獎學(xué)金、常樂制藥獎學(xué)金等企業(yè)獎學(xué)金。堅(jiān)持文化育人、實(shí)踐育人，培養(yǎng)應(yīng)用型、創(chuàng)新型、復(fù)合型人才，畢業(yè)生動手能力強(qiáng)、綜合素質(zhì)高。多年來，本科生考研率穩(wěn)步提高，2020年考研率高達(dá)50％，就業(yè)率穩(wěn)定在98%左右。涌現(xiàn)出原河南省藥監(jiān)局局長張澤書，河南省衛(wèi)計(jì)委主任闞全程，河南泰豐集團(tuán)董事長徐攀峰，揚(yáng)子江藥業(yè)集團(tuán)廣州公司總經(jīng)理臧鑫炎等一大批中高級醫(yī)藥行業(yè)經(jīng)營管理人才和業(yè)務(wù)骨干。13000多名校友遍布海內(nèi)外。