中醫(yī)文獻(xiàn)與文化研究院是全國最早成立的中醫(yī)文獻(xiàn)專門研究機(jī)構(gòu)之一。其建設(shè)歷程始于1957年成立的中醫(yī)文獻(xiàn)研究組，1976年改稱中醫(yī)文獻(xiàn)研究室，1985年經(jīng)山東省機(jī)構(gòu)編制委員會批準(zhǔn)成立處級建制的中醫(yī)文獻(xiàn)研究所。2006年以中醫(yī)文獻(xiàn)研究所為依托成立信息管理學(xué)院，成為科研兼教學(xué)機(jī)構(gòu)。2017年與信息管理學(xué)院分設(shè)，更名為中醫(yī)文獻(xiàn)與文化研究院。

研究院下設(shè)中醫(yī)文獻(xiàn)、中醫(yī)文化、中醫(yī)學(xué)術(shù)流派、大數(shù)據(jù)與復(fù)雜科學(xué)、針灸學(xué)術(shù)史5個(gè)研究室（中心）和中醫(yī)文獻(xiàn)學(xué)教研室，其中中醫(yī)學(xué)術(shù)流派研究室為國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室。是教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室――中醫(yī)藥經(jīng)典理論實(shí)驗(yàn)室和山東省扁鵲文化研究中心、山東省高校中醫(yī)藥文化協(xié)同創(chuàng)新中心依托單位，也是中華醫(yī)學(xué)會醫(yī)史學(xué)分會和中華中醫(yī)藥學(xué)會醫(yī)史文獻(xiàn)分會主任委員單位。2019年中醫(yī)文獻(xiàn)與文化研究院教工黨支部入選“全國黨建工作樣板支部”。2021年中醫(yī)文獻(xiàn)與文化教師團(tuán)隊(duì)入選第二批“全國高校黃大年式教師團(tuán)隊(duì)”。

徐國仟教授、張燦玾國醫(yī)大師、張志遠(yuǎn)國醫(yī)大師等著名學(xué)者為學(xué)科的壯大奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)，鑄就了“博極醫(yī)源，精勤不倦”的學(xué)術(shù)傳統(tǒng)。研究院現(xiàn)有教職員工17人，其中教授9人、副教授5人，講師2人，助教1人，13人擁有博士學(xué)位，博士生導(dǎo)師7人，碩士生導(dǎo)師3人。有“岐黃學(xué)者”1人，“泰山學(xué)者攀登計(jì)劃”專家1人，國家“973”項(xiàng)目首席科學(xué)家1人，享受國務(wù)院政府特殊津貼專家1人，“全國五一勞動獎(jiǎng)?wù)隆鲍@得者1人，“全國優(yōu)秀科技工作者”1人，首屆“全國中醫(yī)藥高等學(xué)校教學(xué)名師”1人，中華中醫(yī)藥學(xué)會“首席健康科普專家”1人，全國優(yōu)秀中醫(yī)人才1人，山東省教學(xué)名師1人，山東省高校十大師德標(biāo)兵1人，山東省富民興魯勞動獎(jiǎng)?wù)芦@得者1人，山東省優(yōu)秀共產(chǎn)黨員1人。

研究院設(shè)有中醫(yī)醫(yī)史文獻(xiàn)學(xué)博士學(xué)位授予點(diǎn)、中醫(yī)學(xué)博士后流動站，一級學(xué)科科學(xué)技術(shù)史專業(yè)和二級學(xué)科中醫(yī)醫(yī)史文獻(xiàn)專業(yè)碩士學(xué)位授予點(diǎn)。中醫(yī)醫(yī)史文獻(xiàn)學(xué)科是國家重點(diǎn)學(xué)科、國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科、山東省重點(diǎn)學(xué)科強(qiáng)化建設(shè)A級學(xué)科、山東省“泰山學(xué)者”攀登計(jì)劃崗位設(shè)崗學(xué)科、中醫(yī)學(xué)博士后流動站覆蓋學(xué)科、國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥優(yōu)勢學(xué)科繼續(xù)教育基地。中醫(yī)文獻(xiàn)學(xué)和中醫(yī)文化學(xué)是國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科?！爸嗅t(yī)藥文獻(xiàn)與文化研究中心”是山東省“十三五”省級強(qiáng)化建設(shè)人文社會科學(xué)研究基地。

研究院始終秉承著“博極醫(yī)源、精勤不倦”的院訓(xùn)，在傳承精華中奮力爭先，在守正創(chuàng)新中勇立潮頭，為盤活優(yōu)秀中醫(yī)藥文化資源，大力推進(jìn)中醫(yī)藥文化創(chuàng)造性轉(zhuǎn)化、創(chuàng)新性發(fā)展，打造齊魯中醫(yī)藥文化品牌做出了重要貢獻(xiàn)。先后牽頭973項(xiàng)目“中藥藥性理論相關(guān)基礎(chǔ)問題研究”、國家公共衛(wèi)生資金項(xiàng)目“中醫(yī)藥古籍保護(hù)與利用能力建設(shè)”、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“丹參深度開發(fā)、產(chǎn)業(yè)升級關(guān)鍵技術(shù)研究和科技示范”、《中華醫(yī)藏》方書類醫(yī)籍調(diào)研、復(fù)制和內(nèi)容提要編撰等多項(xiàng)國家和省部級課題，起草制定了我國第一部指導(dǎo)中醫(yī)藥古籍整理研究的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《中醫(yī)古籍整理規(guī)范》；研究成果“中藥寒熱藥性科學(xué)內(nèi)涵及其表征體系的研究與應(yīng)用”獲得山東省科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、“中醫(yī)學(xué)術(shù)流派研究與評價(jià)體系的建立及應(yīng)用”獲得中華中醫(yī)藥學(xué)會“李時(shí)珍醫(yī)藥創(chuàng)新獎(jiǎng)”、“基于三元論的中藥藥性評價(jià)體系構(gòu)建與應(yīng)用”獲得教育部高等學(xué)校科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)?！盎谥嗅t(yī)原創(chuàng)思維的中藥藥性理論創(chuàng)新與應(yīng)用”獲得2019年國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。