經(jīng)安徽省人民政府批準(zhǔn)，安徽醫(yī)科大學(xué)臨床藥理研究所于1984年8月成立。

安徽醫(yī)科大學(xué)臨床藥理研究所是我國從事抗炎免疫藥理學(xué)和臨床藥理學(xué)研究的主要學(xué)術(shù)單位之一，是安徽醫(yī)科大學(xué)重要的教學(xué)科研單位。主要開展炎癥免疫性疾病的病理機(jī)制、抗炎免疫藥物的基礎(chǔ)與臨床研究以及創(chuàng)新抗炎免疫藥物研發(fā)等研究，在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、急慢性肝損傷和肝癌等疾病的病理機(jī)制和治療藥物等方面研究取得了顯著成績，得到了國家自然科學(xué)基金（包括重點項目、面上項目、青年基金）、“863”計劃項目、教育部博士點基金、安徽省科技重大專項等各類基金和項目的資助，獲得了安徽省科學(xué)技術(shù)獎一等獎4項、省級科學(xué)技術(shù)獎二等獎4項，主編出版了20多部學(xué)術(shù)著作，發(fā)表SCI期刊收錄論文300多篇。

臨床藥理研究所現(xiàn)有職工32人，其中教授7名，副教授19名，高級實驗師2名。博士生導(dǎo)師7名，碩士生導(dǎo)師33名（含兼職）。團(tuán)隊的年齡、職稱、學(xué)歷學(xué)位、專業(yè)背景等結(jié)構(gòu)合理，是安徽高校首批科技創(chuàng)新團(tuán)隊（中藥抗炎免疫藥理學(xué)）、安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊（抗炎免疫藥物的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究）、安徽高校抗炎免疫藥物科技創(chuàng)新團(tuán)隊。學(xué)術(shù)帶頭人擔(dān)任國際基礎(chǔ)與臨床藥理學(xué)聯(lián)合會臨床藥理學(xué)委員會委員、中國藥理學(xué)會副理事長、中國藥理學(xué)會臨床藥理學(xué)專業(yè)委員會名譽主任委員、中國藥理學(xué)會抗炎免疫藥理學(xué)專業(yè)委員會副主任委員、《中國藥理學(xué)通報》主編等職。

臨床藥理研究所依托學(xué)科藥學(xué)為一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)學(xué)科、安徽省重點建設(shè)學(xué)科、安徽省“雙一流”建設(shè)獎補(bǔ)學(xué)科、安徽省高峰建設(shè)學(xué)科，現(xiàn)擁有藥學(xué)博士后科研流動站、抗炎免疫藥物教育部重點實驗室、抗炎免疫藥物協(xié)同創(chuàng)新中心等學(xué)術(shù)技術(shù)平臺，為學(xué)科發(fā)展、人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、服務(wù)社會和國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流等提供了重要學(xué)術(shù)和技術(shù)支撐。

建所40年來，已培養(yǎng)畢業(yè)了百余名博士、318名碩士和多名博士后研究人員，培養(yǎng)的研究生獲得了全國優(yōu)博論文提名、“中國藥理學(xué)會-施維雅青年藥理學(xué)工作者獎”等榮譽，在各自領(lǐng)域取得了重要成就，多人成為了單位主要領(lǐng)導(dǎo)、學(xué)術(shù)帶頭人或骨干。

臨床藥理研究所積極服務(wù)經(jīng)濟(jì)社會建設(shè)，利用專業(yè)優(yōu)勢推進(jìn)產(chǎn)學(xué)研結(jié)合研究。多年來，與中國科學(xué)院合肥物質(zhì)研究院、安徽安科生物工程（集團(tuán)）股份有限公司、深圳市中潤生物技術(shù)有限公司、揚子江藥業(yè)集團(tuán)、恒瑞醫(yī)藥股份有限公司、浙江海正藥業(yè)股份有限公司等企事業(yè)單位建立了良好的合作，有力促進(jìn)了我國創(chuàng)新藥物的研發(fā)，為醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)發(fā)展和人民健康作出了重要貢獻(xiàn)。

1984年：安徽醫(yī)科大學(xué)臨床藥理研究所成立

1985年：安徽省重點學(xué)科（藥理學(xué)）

1986-1998年：國家衛(wèi)生部臨床藥理基地（抗炎免疫藥）

1990年：藥理學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點（安徽省屬高校首個）

1992年：全國高校先進(jìn)實驗室

1999年：國家藥品臨床研究基地

2003年：藥學(xué)博士后科研流動站（安徽省屬高校首批）

2004年：抗炎免疫藥理學(xué)安徽省重點實驗室

2005年：安徽省中藥研究與開發(fā)重點實驗室組成單位

2005年：安徽高校中藥抗炎免疫藥理學(xué)科技創(chuàng)新團(tuán)隊

2007年：抗炎免疫藥物安徽省工程技術(shù)研究中心

2008年：抗炎免疫藥理學(xué)省部共建教育部重點實驗室立項建設(shè)，2011年通過教育部驗收并更名為“抗炎免疫藥物教育部重點實驗室”，2016年以“良好”等次通過教育部組織的教育部重點實驗室五年定期評估

2008年：安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊

2009年：國家中醫(yī)藥管理局三級實驗室

2011年：藥學(xué)一級學(xué)科博士授權(quán)點

2014年：抗炎免疫藥物安徽省協(xié)同創(chuàng)新中心

2015年：安徽高校抗炎免疫藥物科技創(chuàng)新團(tuán)隊

2017年：安徽省“雙一流”建設(shè)學(xué)科

2019年：安徽省高峰學(xué)科建設(shè)

2021年：安徽醫(yī)科大學(xué)類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎研究中心