南京醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院的辦學歷史可以追溯到1934年建校初期，當時即已開設人體解剖學、藥理學、細菌學、寄生蟲學、病理解剖學、法醫(yī)學、醫(yī)學史等多門醫(yī)學課程。1958年初成立基礎醫(yī)學部。1994年更名為基礎醫(yī)學院。

學院黨委堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，以高質量黨建引領學院高質量發(fā)展，促進黨建工作與事業(yè)發(fā)展深度融合。人體解剖學系教工黨支部2022年通過驗收成為“教育部第二批全國高校黨建工作樣板支部”，病原生物學系教工黨支部2022年入選“教育部第三批全國高校黨建工作樣板支部培育創(chuàng)建單位”，學院黨委2022年入選“江蘇省首批黨建工作標桿院系培育創(chuàng)建單位”，法醫(yī)學系教工黨支部2022年入選“江蘇省首批黨建工作樣板支部培育創(chuàng)建單位”，獲“江蘇省高校黨建工作創(chuàng)新獎”二等獎，“江蘇省高校最佳黨日活動優(yōu)勝獎”“江蘇省關工委優(yōu)質化建設均衡發(fā)展優(yōu)秀工作論文”一等獎等多項榮譽，涌現(xiàn)出“全國模范教師”“江蘇青年五四獎章”“新時代江蘇司法為民好榜樣”“全省司法行政為民先進個人”“江蘇省輔導員年度人物提名”“江蘇省最美抗疫家庭”等一批先進個人。

在高質量黨建引領下，學院高質量發(fā)展成果突出。在2012年教育部全國第三輪學科評估中，我院基礎醫(yī)學一級學科排名全國第七。在2016年教育部全國第四輪學科評估中，基礎醫(yī)學一級學科獲B+等級（全國排名并列第八）。同時，我院基礎醫(yī)學一級學科是江蘇高校優(yōu)勢學科建設工程一期、二期、三期和四期項目立項學科；生物學一級學科是江蘇省“十四五”重點學科，2023年入選江蘇高校優(yōu)勢學科（應用轉型類）建設工程。6門學科進入ESI全球排名前1%，其中“藥理學與毒理學”進入ESI全球前0.5%，分子生物學與遺傳學進入ESI全球前1‰。

目前，基礎醫(yī)學院下設13個學系、1個國家級實驗教學示范中心(基礎醫(yī)學)、1個國家級虛擬仿真實驗教學中心（基礎醫(yī)學）、1個分析測試中心和4個管理辦公室?，F(xiàn)有2個一級學科博士點(基礎醫(yī)學、生物學)、2個博士后流動站、13個二級學科博士點、2個一級學科碩士點、13個二級學科碩士點；1個國家重點學科（藥理學）、1個國家重點(培育)學科（病理學與病理生理學）、1個國家重點一級學科培育建設點（基礎醫(yī)學）、1個省一級學科重點（培育）學科（生物學）、1個省重點學科（生殖醫(yī)學）；1個全國重點實驗室、1個部級重點實驗室、1個國家級國際合作基地、7個省重點實驗室和工程研究中心，擁有一批國內先進水平的科研基地和實驗技術平臺。

學院現(xiàn)有教職工352人，其中專任教師248人，包括教授74人、副教授89人、博士生導師74人、碩士生導師55人。擁有國家杰出青年科學基金獲得者4人、全國模范教師1人、全國優(yōu)秀教師2人、國家海外高層次人才引進計劃7人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選3人、國家優(yōu)秀青年基金6人、江蘇省特聘教授16人、江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”49人。在加強師資隊伍建設的同時，注重整合資源，形成團隊優(yōu)勢，擁有江蘇省雙創(chuàng)團隊3個。

學院承擔全校各學制、各專業(yè)、各層次專業(yè)基礎課和專業(yè)課教學工作，每年完成教學任務約4萬學時。學院擁有國家級教學團隊2個、江蘇高?！扒嗨{工程”優(yōu)秀教學團隊2個；擁有2門國家級一流本科課程，3門國家級精品課程，1門國家雙語教學示范課程，2門國家級精品資源共享課，1門國家級來華留學品牌課程，8門省級一流本科課程，1門省級課程思政示范課程，1門省級高校美育精品課程，10門省級英文授課精品課程，1門省級成人高等教育精品資源共享課程。2018年獲國家級教學成果二等獎?；A醫(yī)學和法醫(yī)學兩個專業(yè)獲批國家一流專業(yè)建設點，基礎醫(yī)學拔尖學生培養(yǎng)基地成功入選國家基礎學科拔尖學生培養(yǎng)計劃2.0基地。

近5年來，基礎醫(yī)學、生物學學科獲得國家級項目180多項，總科研經(jīng)費20500余萬元。其中，國家重點研發(fā)計劃項目(課題)6項；科技創(chuàng)新2030課題2項；國家自然科學基金杰出青年基金項目1項，優(yōu)秀青年科學基金項目4項，重點項目6項。在Cell、Nature、Cell Metab、Nat Immunol、Circulation、Nat Neurosci、Nat Cell Biol、ACS Nano、Advanced Functional Materials、Adv Sci、Am J Respir Crit Care Med、Autophagy、EMBO J、Gut、Hepatology、J Clin Invest、J Exp Med、Mol Psychiatry、Nat Commun等權威學術期刊上的發(fā)表高水平論文850余篇。獲得教育部高等學校科學研究優(yōu)秀成果獎（科學技術）二等獎1項、江蘇省科學技術獎二等獎3項、江蘇省高等學?？茖W技術研究成果獎4項。授權發(fā)明專利110多項，成果轉化近20項。

踏上“十四五”發(fā)展新征程，學院全體教職工將繼續(xù)秉承“厚德博學，篤行創(chuàng)新”的院訓精神，堅持以學科建設為抓手，以制度創(chuàng)新為動力，以科學評價為導向，深化綜合改革，推動內涵建設，提升綜合實力，勵精圖治，攻堅克難，為助推國際知名、特色鮮明的高水平研究型醫(yī)科大學建設而努力奮斗!