商船學(xué)院成立于1995年4月，現(xiàn)設(shè)有學(xué)院辦公室、航海技術(shù)系、輪機(jī)工程系、學(xué)生工作部等教學(xué)運(yùn)行機(jī)構(gòu)。商船學(xué)院作為國(guó)家培養(yǎng)高級(jí)航海技術(shù)人才的基地，以“重素質(zhì)，保質(zhì)量，培養(yǎng)敬業(yè)精神好，外語(yǔ)水平高，實(shí)踐能力強(qiáng)的高級(jí)國(guó)際航海人才”為辦學(xué)目標(biāo)。自1972年以來(lái)，已有19000余名航海類專業(yè)畢業(yè)生走出校門(mén)，投身航運(yùn)事業(yè)，其中許多人已成為我國(guó)國(guó)內(nèi)外運(yùn)輸和航?？萍际聵I(yè)的骨干力量，為我國(guó)的航運(yùn)現(xiàn)代化建設(shè)做出巨大貢獻(xiàn)。

目前學(xué)院擁有2個(gè)一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)（交通運(yùn)輸工程、船舶與海洋工程），3個(gè)二級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)（交通信息工程及控制、載運(yùn)工具運(yùn)用工程、輪機(jī)工程），3個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)（交通運(yùn)輸工程、船舶與海洋工程、動(dòng)力工程及工程熱物理），3個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)（交通信息工程及控制、載運(yùn)工具運(yùn)用工程、輪機(jī)工程），5個(gè)工程類專業(yè)學(xué)位類別（交通運(yùn)輸、電子信息、機(jī)械、土木水利、能源動(dòng)力），6個(gè)工程類專業(yè)學(xué)位領(lǐng)域（水路交通運(yùn)輸、人工智能、船舶工程、海洋工程、動(dòng)力工程、清潔能源技術(shù)）。其中載運(yùn)工具運(yùn)用工程為上海市重點(diǎn)學(xué)科，輪機(jī)工程為上海市教委重點(diǎn)學(xué)科。本科設(shè)有航海技術(shù)、輪機(jī)工程、船舶電子電氣工程和能源與動(dòng)力工程等4個(gè)專業(yè)。其中航海技術(shù)、輪機(jī)工程和船舶電子電氣工程專業(yè)為國(guó)家級(jí)特色專業(yè)建設(shè)點(diǎn)和上海市屬高校應(yīng)用型本科試點(diǎn)建設(shè)專業(yè)；航海技術(shù)和輪機(jī)工程專業(yè)為教育部卓越工程師教育培養(yǎng)計(jì)劃專業(yè)(2012年)、國(guó)家級(jí)一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)(2019年) 和上海市本科教育高地；能源與動(dòng)力工程專業(yè)為上海市一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)(2020年)；輪機(jī)工程碩士學(xué)位、輪機(jī)工程和船舶電子電氣工程本科專業(yè)通過(guò)英國(guó)輪機(jī)工程及海事科技學(xué)會(huì)（IMarEST）認(rèn)證（2022年）；航海技術(shù)專業(yè)通過(guò)中國(guó)工程教育認(rèn)證（2023年）。

商船學(xué)院具有較完備的教學(xué)、實(shí)驗(yàn)和科研設(shè)施，設(shè)有10個(gè)教研室、2個(gè)教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心和1個(gè)教學(xué)平臺(tái)。擁有組合式液貨模擬船教學(xué)平臺(tái)（吳淞號(hào)）、綜合船橋系統(tǒng)（IBS）實(shí)驗(yàn)室、船舶操縱模擬器、電子海圖、全球海上遇險(xiǎn)和安全系統(tǒng)（GMDSS）、輪機(jī)模擬器、船舶機(jī)艙綜合實(shí)驗(yàn)室、柴油機(jī)特性測(cè)試、制冷空調(diào)、水泵性能測(cè)試、冷藏集裝箱綜合實(shí)驗(yàn)室、冷庫(kù)等具有先進(jìn)水平的實(shí)驗(yàn)設(shè)備；擁有4.8萬(wàn)噸散裝無(wú)限航區(qū)多功能教學(xué)實(shí)習(xí)船“育明”輪和各類航海專業(yè)技能訓(xùn)練所需的艇筏與配套設(shè)備；成立了上海海事大學(xué)－中國(guó)海運(yùn)（集團(tuán)）總公司國(guó)家級(jí)實(shí)踐教育中心等40家校外實(shí)習(xí)基地。

學(xué)院現(xiàn)有在編教職工208人。專任教師141人，其中教授26人，研究員1人，副教授 53人；實(shí)驗(yàn)員39人，其中，高級(jí)工程師6人，工程師20人。學(xué)院教師中持有海員高級(jí)船長(zhǎng)證書(shū)3人，船長(zhǎng)證書(shū)18人，持有高級(jí)輪機(jī)長(zhǎng)證書(shū)1人，輪機(jī)長(zhǎng)證書(shū)17人。

商船學(xué)院國(guó)際交流與合作項(xiàng)目日益擴(kuò)大和深入，極大促進(jìn)了學(xué)院的國(guó)際化辦學(xué)水平。近年來(lái)，有來(lái)自IMO（國(guó)際海事組織）、美國(guó)麻省海事學(xué)院、美國(guó)圣地亞哥海事學(xué)院等不同國(guó)家的外籍專家、教師來(lái)院進(jìn)行短期講學(xué)；學(xué)院與美國(guó)麻省海事學(xué)院、丹麥哥本哈根輪機(jī)工程學(xué)院、日本東京海洋大學(xué)、韓國(guó)木浦海洋大學(xué)等知名院校建立了留學(xué)生互訪、交流學(xué)習(xí)等合作。