黑龍江中醫(yī)藥大學基礎(chǔ)醫(yī)學院前身為黑龍江中醫(yī)學院基礎(chǔ)醫(yī)學部，始創(chuàng)于1972年4月,1997年7月更名為基礎(chǔ)醫(yī)學院。學院現(xiàn)下設(shè)19個教研室，由中醫(yī)基礎(chǔ)系列、西醫(yī)基礎(chǔ)系列兩部分組成，承擔著學校各專業(yè)本科生、研究生及留學生等的中醫(yī)、西醫(yī)基礎(chǔ)課程教學工作和相關(guān)科研工作。經(jīng)過40多年的建設(shè)與發(fā)展，現(xiàn)已成為黑龍江中醫(yī)藥大學人才培養(yǎng)、教學和科學研究的重要基地。

學院擁有國家級重點學科1個、國家中醫(yī)藥管理局重點學科4個，省級重點學科5個；國家中醫(yī)藥管理局三級重點實驗室2個，國家中醫(yī)藥管理局重點研究室1個，黑龍江省教育廳高校重點實驗室1個，全國名老中醫(yī)藥專家傳承工作室3個；具有博士學位授權(quán)學科5個、碩士學位授權(quán)學科7個；現(xiàn)有全日制在校研究生160人，其中博士研究生42人，港澳臺及留學博士生6人；碩士研究生109人，港澳臺及留學碩士生3人。

近三年主持國家級科研項目13項，省部級科研項目22項，廳局級科研項目27項；獲得黑龍江省科學技術(shù)獎8項，廳局級科學技術(shù)獎24項；發(fā)表科研論文353篇，其中SCI、EI收錄19篇。

學院學科研究平臺使用面積1773.53平方米，擁有配套設(shè)施完善、較為先進的儀器設(shè)備564臺件，總值2768萬元。各大型儀器設(shè)備學科間均可共享，為開展各層次的科學研究奠定了良好的基礎(chǔ)。

學院秉持“立德樹人、求實創(chuàng)新；教研并重、篤學力行”的工作理念，突出教學工作的中心地位，堅持人才培養(yǎng)質(zhì)量是生命線這一根本；以學生為中心，以教師發(fā)展為本位；遵循教育規(guī)律和人才成長規(guī)律，把服務(wù)專業(yè)、夯實基礎(chǔ)、培養(yǎng)能力、提高素質(zhì)作為著力點和落腳點，注重培養(yǎng)學生的學習能力、醫(yī)學思維能力、實踐能力和創(chuàng)新精神；更新教育教學觀念，深化教育教學改革，推動教學質(zhì)量的不斷提升。