呼倫貝爾市蒙醫(yī)藥事業(yè)在70年的發(fā)展歷程中，經(jīng)歷了從無到有、由弱到強的變化，尤其是近年來在國家、自治區(qū)、呼倫貝爾市一系列支持蒙醫(yī)藥發(fā)展的政策惠澤下，蒙醫(yī)藥事業(yè)取得了長足的發(fā)展與進步。2008年，內(nèi)蒙古衛(wèi)生廳批準成立呼倫貝爾市蒙醫(yī)醫(yī)院，按二級甲等醫(yī)院進行建設(shè)，市委、市政府將蒙醫(yī)醫(yī)院建設(shè)項目列為20個公共公益建設(shè)項目之一，投資5000多萬元進行重點建設(shè)。醫(yī)院2010年建成，2011年遷入新址，2012年正式開業(yè)，2013年晉升二級甲等醫(yī)院，2016年晉升三級乙等醫(yī)院，2017年獲批中醫(yī)藥健康旅游示范基地（國家健康旅游會員單位），2018年獲批自治區(qū)蒙醫(yī)藥文化宣傳教育基地和國家第二批住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地，2019年獲批內(nèi)蒙古自治區(qū)首批蒙醫(yī)中醫(yī)名院。短短十年間醫(yī)院取得了跨越式發(fā)展，成為一所以蒙醫(yī)藥為主，集臨床治療、科研教學、預(yù)防保健、蒙藥制劑、醫(yī)養(yǎng)結(jié)合、健康旅游、國際交流、草藥種植等為一體的三級乙等蒙醫(yī)綜合醫(yī)院，承擔著呼倫貝爾地區(qū)蒙醫(yī)藥文化傳承、發(fā)展和國際交流的重任。

蒙藥制劑室是呼倫貝爾地區(qū)規(guī)模最大、設(shè)備先進的蒙藥制劑研發(fā)中心，已通過GPP認證，制劑品種達132種，年產(chǎn)量10000公斤。這些制劑驗方合理、療效確切、安全可靠，深受廣大患者的認可和信賴。

呼倫貝爾市蒙醫(yī)醫(yī)院建有建有國家重點建設(shè)?？?個（蒙醫(yī)五療科），自治區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)先學科1個（蒙醫(yī)五療科-針灸推拿學），自治區(qū)蒙醫(yī)重點特色專科專病4個（心病科、腦病科、肝病科、心身醫(yī)學科），呼倫貝爾市重點蒙醫(yī)特色?？茖２?個（腦病、心病、骨傷、肛腸、風濕、五療、肝膽、布病、過敏性紫癜）。自治區(qū)草原英才1人，自治區(qū)老蒙醫(yī)學術(shù)經(jīng)驗指導(dǎo)老師10人，自治區(qū)基層名蒙醫(yī)1人，呼倫貝爾市名蒙醫(yī)5人。承擔著內(nèi)蒙古醫(yī)科大學蒙醫(yī)藥學院、內(nèi)蒙古醫(yī)科大學鄂爾多斯分院、內(nèi)蒙古民族大學蒙醫(yī)藥學院、呼倫貝爾職業(yè)技術(shù)學院的臨床帶教工作，也是內(nèi)蒙古醫(yī)科大學和內(nèi)蒙古民族大學的研究生培養(yǎng)基地，碩士生導(dǎo)師6人，在培研究生8名。承擔各級科研項目共18項，其中國家級3項、自治區(qū)級11項、市級4項，呼倫貝爾市級非物質(zhì)文化遺產(chǎn)代表性項目——蒙醫(yī)敷血療法、布里亞特傳統(tǒng)綿羊療法、小兒巴日呼療法。承擔制定自治區(qū)蒙醫(yī)藥標準化項目《蒙藥材藍盆花、多葉棘豆、小白蒿標生產(chǎn)規(guī)范及標準制定》和《3種“地格達”（肋柱花、梅花草、扁蕾）類蒙藥材標準化種植技術(shù)研究》項目，在對特色蒙藥材產(chǎn)地自然條件、育苗技術(shù)、栽培與田間管理、病蟲害防治、采收加工等方面制定生產(chǎn)技術(shù)標準，初步形成行業(yè)標準和地方標準，為特色蒙藥材規(guī)范化種植（GAP）基地建設(shè)提供技術(shù)支撐，奠定科研基礎(chǔ)。同時積極推進呼倫貝爾地區(qū)蒙醫(yī)藥文化傳承，拓展蒙醫(yī)藥研究新領(lǐng)域，不斷提升蒙醫(yī)藥科研能力，與內(nèi)蒙古民族大學蒙醫(yī)藥研究中心合作成立呼倫貝爾分院，致力于呼倫貝爾蒙醫(yī)藥挖掘整理、蒙藥資源普查與蒙藥栽培技術(shù)研究、特色蒙藥驗方研究等，編寫出版《呼倫貝爾蒙醫(yī)驗方集》等3部著作。多項科研成果獲獎。