內(nèi)蒙古民族大學(xué)馬克思主義學(xué)院原為馬列教研部，2000年8月，由原內(nèi)蒙古民族師范學(xué)院、內(nèi)蒙古蒙醫(yī)學(xué)院和哲里木畜牧學(xué)院三所本科院校的馬列教研部合并而成。2009年1月16日，馬列教研部更名為馬克思主義學(xué)院。2017年5月，被評為首批內(nèi)蒙古自治區(qū)黨委宣傳部與學(xué)校共建的重點馬克思主義學(xué)院。2017年7月，思想政治教育專業(yè)（師范類）由政法與歷史學(xué)院調(diào)整到馬克思主義學(xué)院。自此，馬克思主義學(xué)院不僅承擔(dān)著全校本專科生和研究生的思想政治理論課教學(xué)任務(wù)，同時也開始承擔(dān)思想政治教育本科專業(yè)建設(shè)和人才培養(yǎng)的任務(wù)，開始形成了本科生和碩士研究生相銜接的人才培養(yǎng)體系。

現(xiàn)設(shè)有馬克思主義基本原理、毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論、習(xí)近平新時代中國特色社會主義思想概論、中國近現(xiàn)代史綱要、思想道德與法治、中華民族共同體概論、形勢與政策7個教研室，基地建設(shè)管理中心、思想政治教育專業(yè)建設(shè)中心、思政課程實踐教學(xué)管理中心3個中心；內(nèi)蒙古自治區(qū)品牌專業(yè)1個、自治區(qū)精品課2門、一流課程2門、校級精品課2門、校級優(yōu)秀課程1門、校級優(yōu)秀教學(xué)團隊3個、實踐教學(xué)基地2個；馬克思主義理論一級學(xué)科碩士點1個、二級學(xué)科碩士點5個、專業(yè)碩士學(xué)位點1個?，F(xiàn)有“內(nèi)蒙古鑄牢中華民族共同體意識研究基地”“內(nèi)蒙古鑄牢中華民族共同體意識大中小學(xué)思政課一體化教師培訓(xùn)基地”“內(nèi)蒙古思想政治理論課虛擬仿真體驗教學(xué)中心”各1個，是內(nèi)蒙古自治區(qū)首批人文社會科學(xué)研究基地——“內(nèi)蒙古東部經(jīng)濟歷史文化研究基地”“內(nèi)蒙古自治區(qū)社會主義核心價值體系研究基地”及國家民委首批人文社科重點研究基地——“蒙古族歷史文化與社會發(fā)展研究基地”的重要支撐單位；設(shè)有“大學(xué)生思想政治教育研究所”“北方民族研究所”“內(nèi)蒙古民族大學(xué)思維機制及功能研究所”。