園藝與植物保護學院組建于2018年，學院歷史可追溯到 1952年。新中國成立不久，在黨中央親切關(guān)懷下，國家抽調(diào)北京農(nóng)業(yè)大學、河北農(nóng)學院、山西農(nóng)學院等院校優(yōu)秀教師支援內(nèi)蒙古建設(shè)，組建內(nèi)蒙古畜牧獸醫(yī)學院，同時開始籌備蔬菜學、果樹學和植物保護學等專業(yè)。1958年開始招收植物保護、果蔬等本科專業(yè)。

目前，擁有園藝學和植物保護學2個一級學科博士學位授權(quán)點，農(nóng)藝與種業(yè)和資源利用與植物保護2個專業(yè)學位授權(quán)點。學院現(xiàn)有園藝學1個自治區(qū)級“雙一流建設(shè)學科”；蔬菜學和果樹學 2 個自治區(qū)級重點學科和農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治 1 個自治區(qū)級重點培育學科。擁有“內(nèi)蒙古自治區(qū)野生特有蔬菜種質(zhì)資源與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室”、“生物農(nóng)藥創(chuàng)制與資源利用自治區(qū)高等學校重點實驗室”（培育建設(shè)）、“內(nèi)蒙古自治區(qū)設(shè)施園藝工程技術(shù)研究中心”和“內(nèi)蒙古自治區(qū)寒旱區(qū)作物保護工程技術(shù)研究中心” 4 個省級科學研究平臺，1個國家級中職教師設(shè)施農(nóng)業(yè)生產(chǎn)技術(shù)培訓基地，1個中蒙俄設(shè)施園藝產(chǎn)業(yè)科技創(chuàng)新研究院；建有“作物土傳病害微生態(tài)調(diào)控院士工作站”和“草原昆蟲研究中心”（與中國科學院共建）。

學院現(xiàn)開設(shè)園藝（國家級一流專業(yè)建設(shè)點、自治區(qū)級品牌專業(yè)）、植物保護（國家級一流專業(yè)建設(shè)點，自治區(qū)級品牌專業(yè)）和設(shè)施農(nóng)業(yè)科學與工程3個本科專業(yè)?，F(xiàn)有教職工71人，其中教授21人，副教授17人，高級實驗師3人；博士生導師16人，碩士生導師33人，已取得博士學位教師50人；現(xiàn)有特聘院士2人(中國科學院院士和荷蘭皇家科學院院士各1名)，全國優(yōu)秀農(nóng)業(yè)科技工作者1人，自治區(qū)有突出貢獻的中青年專家1人，自治區(qū)新世紀“321”人才工程10人，自治區(qū)教育廳“111”人才工程3人，自治區(qū)“草原英才”7人，自治區(qū)“草原英才”團隊1個，國家產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學家2人，自治區(qū)級教壇新秀1人。

學院已形成學歷層次、職稱、年齡結(jié)構(gòu)合理而穩(wěn)定的師資隊伍。目前承擔著國家自然基金項目、國家863、973 、科技支撐計劃項目、公益性行業(yè)（農(nóng)業(yè)）科研專項經(jīng)費項目、國家重點研發(fā)計劃等共計 80 余項，與中國科學院、中國農(nóng)科院、中國農(nóng)業(yè)大學等科研院所有著密切的科研合作關(guān)系，并與美國、日本、德國、荷蘭、西班牙等國相關(guān)科研院所建立了良好的合作關(guān)系。

學院秉承教學、科研、生產(chǎn)、社會服務(wù)相結(jié)合模式，現(xiàn)已培養(yǎng)農(nóng)業(yè)科技人才4000多名，其中有杰出的中國科學院院士康樂院士以及全國科研院所大專院校的學者專家和各行各業(yè)杰出的帶頭人管理者，遍及全國各地、為國家及自治區(qū)經(jīng)濟社會發(fā)展做出了巨大貢獻。