空軍軍醫(yī)大學軍事醫(yī)學心理學系前身可追溯至成立于1960年的第四軍醫(yī)大學空軍醫(yī)學系心理學教研室，歷次更名為第四軍醫(yī)大學航空航天醫(yī)學系心理學教研室、第四軍醫(yī)大學醫(yī)學心理學系、空軍軍醫(yī)大學醫(yī)學心理學系，2017年11月正式更名為空軍軍醫(yī)大學軍事醫(yī)學心理學系。

50多年來，在陳南宜、皇甫恩、苗丹民等幾代學科帶頭人的努力下，心理學科奠定了引領全軍心理學發(fā)展的地位。概括起來有3個最早和5個唯一。全軍最早有建制的心理學教學科研機構（1960年），全軍最早開設本科生心理學課程的教學單位（1963年），全軍最早心理學碩士學位授權學科（1993年）；全軍唯一軍事醫(yī)學心理學重點實驗室（2001年），全軍唯一心理學博士學位授權學科（2003年），國防部全國唯一征兵心理檢測技術中心(2006年)，全軍唯一心理學一級學科（2010年）和全軍唯一心理學博士后流動站（2012年）。在最新教育部學位與研究生教育發(fā)展中心公布的全國第四輪學科評估中，作為軍隊院校心理學科唯一上榜的單位，軍事醫(yī)學心理學系在評估劃定的八個檔次中位于第四檔，在全部參評的51個院校（23個博士授權學科和28個碩士授權學科）中排名第11位。

軍事醫(yī)學心理學系設置1個機關、4個教研室（基礎心理學教研室、臨床心理學教研室、航空航天心理學教研室、軍事心理學教研室）和1個教學實驗中心。實驗室占地面積1500平方米，設有心理測評實驗室、心理訓練實驗室、腦電生理實驗室、眼動實驗室、生物反饋實驗室、虛擬現(xiàn)實實驗室、飛行錯覺實驗室、心理治療實驗室、心理咨詢與行為觀察實驗室，儀器設備總價值1300余萬元。

目前全系共有工作人員26人，教授4名、副教授4名，博士研究生導師3名、碩士研究生導師7名。導師隊伍中80%以上具有應用心理學或醫(yī)學博士學位，75%以上有美、英、日、澳、瑞典等留學經(jīng)歷，2人赴以色列參加軍事心理學短期受訓。擁有原總后勤部院士后備人選1人，全國優(yōu)秀科技工作者1人，軍隊高層次創(chuàng)新工程領軍人才1人，全軍杰出專業(yè)技術人才1人，國防大學客座教授1人；軍隊院校育才獎金獎獲得者1人，銀獎獲得者3人。

軍事醫(yī)學心理學系是全軍心理衛(wèi)生研究中心，是中國心理學會軍事心理學專業(yè)委員會、全軍心理學專業(yè)委員會、中國康復醫(yī)學會康復心理學專業(yè)委員會等學會的掛靠單位和/或主任委員單位；是國家教育部高等院校心理學教學指導委員會、中國社會心理學會軍事心理學專業(yè)委員會、中國心理學會科普專業(yè)委員會、全軍心理衛(wèi)生專家咨詢和指導委員會、陜西省心理學會等學會副理事長/副主任委員單位。

軍事醫(yī)學心理學系自2012年起招收臨床醫(yī)學（心理學方向）本科生。同時，招收應用心理學專業(yè)、醫(yī)學心理學專業(yè)碩士和博士研究生。年均承擔學歷教育和任職培訓教育近2000學時，累計為國家和軍隊培養(yǎng)了博士后5名（含在站）、博士研究生79名、碩士研究生259名（1人獲全國優(yōu)秀碩士學位論文）、學士29名、各類心理骨干12000余名。

軍事醫(yī)學心理學系一直是大學為社會服務、為軍服務的“名片”。先后完成抗震救災等多樣化軍事行動的心理保障、救援和演練任務。年均為社會、為軍隊心理服務200余人次，授課50余場次，受益軍民超過10萬人。