2001年，組建青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院生物科學(xué)系。2004年，生物科學(xué)系成為青海大學(xué)直屬系。2012年5月，在原青海大學(xué)生物科學(xué)系基礎(chǔ)上成立青海大學(xué)生態(tài)環(huán)境工程學(xué)院。學(xué)院順應(yīng)國家生態(tài)文明建設(shè)戰(zhàn)略和青海省生態(tài)立省戰(zhàn)略、國家新興戰(zhàn)略性產(chǎn)業(yè)——生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)和青藏高原特色生物資源保護利用產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求，先后設(shè)立生物技術(shù)、環(huán)境科學(xué)、生物工程、環(huán)境生態(tài)工程和生態(tài)學(xué)5個專業(yè)以及生態(tài)學(xué)一級學(xué)科和資源生物學(xué)交叉學(xué)科2個碩士學(xué)位授權(quán)點。全院60名教職工中，教授13名，副教授26名，博士生導(dǎo)師7名、碩士生導(dǎo)師21名，博士學(xué)位教師總?cè)藬?shù)為38名，博士比例達到63%。是青海大學(xué)教學(xué)院系中教師學(xué)歷層次最高的學(xué)院之一。

擁有省級生物學(xué)重點學(xué)科、省級生物科學(xué)實驗教學(xué)示范中心、省級分子生物學(xué)與生物化學(xué)重點實驗室以及中美猶他綠色聯(lián)盟——新能源示范中心、高原水生生物和生態(tài)研究所和青海大學(xué)生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展研究所。自2002年以來，先后由清華大學(xué)、西北農(nóng)林科技大學(xué)開展對學(xué)院的對口支援工作，在學(xué)科建設(shè)、師資培養(yǎng)、學(xué)生培養(yǎng)、實驗室建設(shè)和科研合作等方面給予了大力支持。

近年來，學(xué)院1400人左右的在校本科生中內(nèi)地生源和本地生源比為4:6。我院本科生的英語四、六級通過率和考研率一直名列全校前茅，20%以上的本科生進入中國科學(xué)院相關(guān)研究所、清華大學(xué)、南京大學(xué)、廈門大學(xué)、中國地質(zhì)大學(xué)、湖南大學(xué)、蘭州大學(xué)、貴州大學(xué)、西北農(nóng)林科技大學(xué)等國內(nèi)重點大學(xué)繼續(xù)深造。在校本科生參加省級以上競賽的比例達20%以上；每年獲得國家獎學(xué)金、二炮獎學(xué)金、優(yōu)秀學(xué)生獎學(xué)金等各類別獎學(xué)金的學(xué)生占學(xué)生總數(shù)的20%以上。本科生的畢業(yè)論文全部來自于教師的科研課題。學(xué)院積極整合校內(nèi)外教育教學(xué)資源，積極創(chuàng)新本科人才培養(yǎng)模式，先后組建“高原生物學(xué)菁英班”和“三江源國家公園專業(yè)技術(shù)人才培養(yǎng)班”，與科研院所和國家公園管理部門聯(lián)合培養(yǎng)生態(tài)保護本科專業(yè)人才。

學(xué)院擁有省級生物學(xué)重點學(xué)科、省級生物科學(xué)實驗教學(xué)示范中心、省級分子生物學(xué)與生物化學(xué)重點實驗室以及中美猶他綠色聯(lián)盟——新能源示范中心、高原水生生物和生態(tài)研究所和青海大學(xué)生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展研究所。近年來，學(xué)院積極組織力量，先后承擔(dān)了省部共建三江源生態(tài)與高原農(nóng)牧業(yè)國家重點實驗室、三江源生態(tài)一流學(xué)科建設(shè)、生態(tài)學(xué)一級學(xué)科博士點碩士點和生態(tài)學(xué)本科專業(yè)等的申報工作，為國家重點實驗室和三江源生態(tài)一流學(xué)科的獲批貢獻了力量。在校黨委的領(lǐng)導(dǎo)下，在清華大學(xué)、西北農(nóng)林科技大學(xué)的對口幫扶下，學(xué)科建設(shè)取得了長足的進步。學(xué)院圍繞著生態(tài)學(xué)一流學(xué)科建設(shè)這一核心任務(wù)，2017年申報獲批生態(tài)學(xué)一級學(xué)科碩士點，生態(tài)學(xué)本科專業(yè)于2018年開始招生。學(xué)院擁有國家級精品視頻公開課、省級精品課程、校級精品課程各1門；一流課程7門、校級核心課程10門、校級課堂教學(xué)和考試綜合改革建設(shè)4門、校級素質(zhì)類選修課程建設(shè)4門、校級實驗課程建設(shè)2門、校級課程思政示范課2門。主持完成校級教研教改項目17項、校級教材建設(shè)項目2項。

學(xué)院以青藏高原獨特的區(qū)域優(yōu)勢和豐富的生物資源為研究對象，立足國家生態(tài)文明建設(shè)戰(zhàn)略和“生態(tài)立省”戰(zhàn)略，圍繞青藏高原生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展中的重大瓶頸問題，開展高原動物、植物和極端環(huán)境微生物資源保護和利用、青藏高原生態(tài)環(huán)境保護與評價、天然產(chǎn)物應(yīng)用研究與開發(fā)等方面的研究。目前我院共承擔(dān)各類科研項目48項，科研總金額2232.4萬元；近3年共發(fā)表論文127篇，其中SCI收錄論文58篇；2012年，《青海湖裸鯉物種保護技術(shù)研究》分獲中國水產(chǎn)科學(xué)研究院科技進步獎二等獎和青海省科學(xué)技術(shù)進步獎二等獎各1項；2017年，《青海湖裸鯉人工增殖放流技術(shù)集成及應(yīng)用》獲青海省科學(xué)技術(shù)進步獎一等獎1項、《青海湖裸鯉人工增殖放流技術(shù)》獲得中國水產(chǎn)科學(xué)研究院科技進步獎三等獎1項。2018年，學(xué)院成為青海省農(nóng)牧業(yè)科技創(chuàng)新平臺——冷水養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)技術(shù)轉(zhuǎn)化研發(fā)與水生生物保護平臺的技術(shù)依托單位，李長忠教授擔(dān)任首席專家。

2002年清華大學(xué)對口支援青海大學(xué)生物科學(xué)系（2012年更名為生態(tài)環(huán)境工程學(xué)院）工作啟動以來，在校黨委正確領(lǐng)導(dǎo)和各相關(guān)單位的關(guān)心與支持下，清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院（原生物科學(xué)與技術(shù)系）和環(huán)境學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)和老師們的鼎立相助下，經(jīng)過學(xué)院全體師生的齊心努力，學(xué)院在一流學(xué)科建設(shè)、課程建設(shè)、實驗室建設(shè)、學(xué)位點建設(shè)、師資隊伍建設(shè)和科研等方面取得了顯著成效，初步建成了服務(wù)于全校生物類和非生物類本科生和碩士研究生理論教學(xué)和實踐教學(xué)的公共基礎(chǔ)平臺，教學(xué)水平、管理水平和科研水平得到明顯提高，為生態(tài)環(huán)境工程學(xué)院的長足發(fā)展奠定了堅實的基礎(chǔ)。2011年，增列西北農(nóng)林科技大學(xué)為對口支援單位，由西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院和資源環(huán)境學(xué)院開展對口幫扶，并選派李玉平博士擔(dān)任院領(lǐng)導(dǎo)。2015年，清華大學(xué)環(huán)境學(xué)院開始對口支援工作。

清華大學(xué)對口支援我院十七年來，生命科學(xué)學(xué)院黨委書記吳慶余教授、院長王宏偉教授、副院長陳曄光教授、學(xué)位委員會主席張秀芳教授、副院長張榮慶教授、黨委副書記兼生命科學(xué)實驗教學(xué)示范中心主任張貴友副教授、示范中心主任屠萍官教授以及清華大學(xué)環(huán)境學(xué)院劉毅書記等來學(xué)院指導(dǎo)學(xué)科建設(shè)、人才培養(yǎng)和科學(xué)研究工作。

西北農(nóng)林科技大學(xué)對口支援我院八年來，呂家瓏院長、韋革宏院長、張帆副院長、陶士珩教授等親臨青海大學(xué)生態(tài)環(huán)境學(xué)院指導(dǎo)工作，指導(dǎo)學(xué)科建設(shè)和人才培養(yǎng)工作。

迄今為止，對口支援院校先后有近50人次來我院做學(xué)術(shù)報告，青海大學(xué)參加學(xué)術(shù)報告會的教師在1500人次以上。指導(dǎo)20多門本科課程建設(shè)，2次參加本科教學(xué)計劃的修改論證，10多次修改完善平臺建設(shè)項目。尤其是在國家重點實驗室建設(shè)、生態(tài)學(xué)一流學(xué)科建設(shè)、生態(tài)學(xué)一級學(xué)科碩士點建設(shè)方面積極作為，助力申報工作。近年來，有30多名本科生到對口支援院校攻讀學(xué)位。我院6名年輕教師到口支援院校攻讀博士學(xué)位，有30多人次到對口支援院校進行單科進修和短期培訓(xùn)。

面對取得的成績，我們對清華大學(xué)和西北農(nóng)林科技大學(xué)的領(lǐng)導(dǎo)和老師們充滿感激之情！面對未來，我們充滿信心。我們將總結(jié)過去對口支援的經(jīng)驗，積極探索對口支援的新模式，開創(chuàng)對口支援工作的新局面。

隨著2016年“省部共建三江源生態(tài)與高原農(nóng)牧業(yè)國家重點實驗室”、2017年青海大學(xué)三江源生態(tài)學(xué)科進入一流學(xué)科建設(shè)行列、生態(tài)學(xué)一級學(xué)科碩士授權(quán)點和生態(tài)學(xué)本科專業(yè)等的先后獲批，生態(tài)學(xué)一流學(xué)科及其相關(guān)的學(xué)科群建設(shè)走上了快車道。全院師生在校黨委的堅強領(lǐng)導(dǎo)下，緊緊抓住學(xué)校發(fā)展的有利時機，扎實推進學(xué)院師資隊伍建設(shè)、提升科研能力、提高本科培養(yǎng)水平，勠力同心、迎難而上，續(xù)寫新的篇章。